健康診断で初めて胃カメラするんだけど、怖くて泣きそう🎦

https://www.k.u-tokyo.ac.jp/information/category/press/10660.html

胃・十二指腸潰瘍のなりやすさの遺伝学 ― 胃壁細胞分化とホルモン調節の多様性が関わる

◆日本人と欧米人を統合する最新のゲノムワイド関連解析により、胃・十二指腸潰瘍の発症と関連する25カ所の遺伝的座位を新たに同定しました。

◆一細胞トランスクリプトーム解析などのデータと統合することで、胃壁の細胞分化とホルモン調節における遺伝的多様性が、胃・十二指腸潰瘍のなりやすさを左右する因子であることが示唆されました。

◆本研究は胃・十二指腸潰瘍やその後の胃癌との関わりに関する更なる医学研究のための洞察を与える他、ポリジェニック・リスク・スコアの計算に基づく予防的医療の構築、ひいては医療費削減につながると期待されます。

発表概要
東京大学大学院新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻の賀云野、松田浩一教授、鎌谷洋一郎教授、谷川千津准教授、小井土大助教、史明陽特任研究員、同大学医科学研究所バイオバンク・ジャパンの森崎隆幸客員教授、人癌病因遺伝子分野の村上善則教授、公共政策研究分野の永井亜貴子特任研究員、岩手医科大学医歯薬総合研究所生体情報解析部門の清水厚志教授、同大学いわて東北メディカル・メガバンク機構生体情報解析部門の須藤洋一特命准教授、八谷剛史客員教授、山﨑弥生特命助教、マギル大学のHans Markus Munterらの共同研究グループは、大規模な胃・十二指腸潰瘍のゲノムワイド関連解析を実施し、胃・十二指腸潰瘍に関連する新たな遺伝的座位（注2、以下「座位」と言います）を25カ所同定しました。検出した座位から細胞の分化やガストリン・シグナリング（注3）の関与が示唆され、また一細胞トランスクリプトーム（注4）データを統合することによりソマトスタチンを産生するD細胞の関与が示唆されました。

この研究成果を利用してポリジェニック・リスク・スコアの構築が可能であり、将来的には胃・十二指腸潰瘍に遺伝的になりやすい体質であるかどうかを一定程度予測し予防することで医療費削減につながると期待されます。

発表内容
胃潰瘍と十二指腸潰瘍（合わせて消化性潰瘍とも呼びます）は胃や十二指腸の表面の粘膜が損傷する疾患で、直接の原因としてヘリコバクター・ピロリ（ピロリ菌、注7）感染または非ステロイド性抗炎症薬（NSAIDs、注8）の服用が知られ、心理的ストレス、喫煙、飲酒、そして遺伝因子（注9）は発症リスクを高めることが知られています。その生涯有病率は5〜10％とありふれていますが、出血もしくは胃に穴があく（穿孔する）場合には命に関わります。疫学研究では日本は有病率がかなり高いと報告されています。

本研究グループは、2012年に7,072人の十二指腸潰瘍のゲノムデータを用いてこの病気の世界初のゲノムワイド関連解析（GWAS）を実施し、2つの座位を報告しました（谷川ら、Nat Genet 2012）。2019年には、イギリスで実施された合計約45万人の欧米人のゲノムデータを用いたGWASは8座位を報告しています（Wuら、Nat Commun 2019）。しかし、東アジア人における消化性潰瘍の有病率が高いことから、東アジア人のより大きなサンプルサイズのGWASを実施することで、さらなる消化性潰瘍の遺伝的病因の理解が深まると考えられました。

〈研究の内容〉
消化性潰瘍に関連する遺伝子を検出するため、バイオバンク・ジャパン（BBJ：注10）と東北メディカル・メガバンク（TMM：注11）計画が保有する症例の合計で29,739例、対照群240,675例を組み合わせた日本人メタ解析により25の関連座位を同定しました。そのうち19がこれまでに報告されていないものでした。さらに、日本とヨーロッパ（UK BiobankとFinnGen）の消化性潰瘍52,032例、対照905,344例を組み合わせた複数集団のメタ解析を実施しました（図1）。この段階では更なる6つの関連座位が追加で検出され、合計25の新規座位を発見しました。
P値は、東アジア人または欧州系集団の52,032例の症例と905,344例の対照を対象とした複数集団メタ解析。一番上の薄いグレーの破線（-log10(P)>20）より上のバリアントについては、値をリスケーリングしている。それぞれのピークに最も近い遺伝子名が示されている。

検出された消化性潰瘍関連座位の遺伝的効果は日本人と欧州系集団で相関していました（r＝0.79）。それに対して、胃潰瘍と十二指腸潰瘍という病型の間では、同じ遺伝構造を共有している（図2a）が、胃潰瘍では遺伝的な効果量が全体としてより小さい（図2c）という違いがあることがわかりました。これは、胃潰瘍の遺伝構造の不均質性を示唆しています

この辺もう何度も何度も何度も立て続けられてる定期スレな